摩尔根证明基因在染色体上是通过杂交试验的方法来得到有效证明的，他所选择的是果蝇，果蝇为实验的材料。其具体的方式是选择红眼跟白眼，分别是雄性和雌性的来进行交配，第1代交配之后雌性的依旧是红眼，又进行了后代的交配，再次交配之后就发生了改变。通过这个实验可以得出来，结果它的眼睛的颜色遗传性就是分离定律，眼睛的红色和白色是受到对等基因的控制的，其中红眼是属于显性的基因。之后摩尔根将基因跟染色体相连，从而有效的证明了基因是存在于染色体上的结论。
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