一、培养目标与方式不同
专业硕士教育的突出特点是学术型与职业性紧密结合，获得专业学位的人，主要不是从事学术研究，而是从事具有明显职业背景的工作，如工程师、医师、教师、律师、会计师等。学术硕士按学科设立，其以学术研究为导向，偏重理论和研究，培养大学教师和科研机构的研究人员。
专业硕士课程设置以实际应用为导向，以职业需求为目标，以综合素养和应用知识与能力的提高为核心。学术硕士的课程设置侧重于加强基础理论的学习，重点培养学生从事科学研究创新工作的能力和素质。
二、报考条件及招生专业不同
专硕报考条件，大部分专业与学硕相同，部分专业如工商管理、公共管理、工程管理等，对考生有相应工作年限的要求。
学硕几乎涵盖全部专业，专业硕士则仅有金融、应用统计、税务、国际商务、保险、资产评估、审计等几十个专业。
三、考试难度及调剂要求不同
对于大部分专业来说，专业硕士较学术硕士难度略低。专业硕士公共课英语科目多考英语二，难度相对较小；学术硕士公共课英语科目考英语一，难度比较大。专业硕士多数不考公共课数学科目或考数学三、经济类联考综合能力，难度相对较小；学术硕士公共课数学科目考数学一、数学二、数学三、数学(农)或招生单位自命题理学数学，难度较大。
考生调剂基本条件，初试科目与调入专业初试科目相同或相近，其中统考科目原则上应相同。学术硕士可以调剂到专业硕士，但专业硕士不能调剂到学术硕士。
四、学费、学制、导师制度及论文要求不同
全日制专业硕士收费标准，按不高于本校现行普通专业学术型自筹经费研究生收费标准确定，学术硕士收费标准，原则上每年硕士生不超过8000元，通常专硕要稍微贵一些。专业硕士学制一般为2-3年，学术硕士学制一般为3年。
专业硕士，实行双导师制。以校内导师指导为主，校外导师应参与实践过程、项目研究、课程与论文等多个环节的指导工作。学术硕士，实行单导师制。
专业硕士的论文，必须强化应用导向，形式可多种多样。学术硕士的学位论文，强调科学理论研究与原创学术创新，形式相对传统，一般为学术性论文。
五、读博方式不一样
专业硕士，一般不能硕博连读或直博，硕士毕业后若进行考博，请咨询招生单位了解相关政策。
学术硕士，可以通过自己的导师直接读博，不用参加全国统考，也就是我们所说的直博或者硕博连读。
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